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CUT&Tag和ChIP-seq比较丨艾美捷全方案
发布时间:2021-10-29        浏览次数:107        返回列表
 之前,弗雷德哈钦森研究中心的Henikoff博士在Nature Communication公开了CUT&Tag技术的详细结果与实验方案。与以往的ChIP-SeqpA-MNase等方法相比,CUT&Tag技术方法简便易行,信噪比高,重复性好,需要的细胞数量少至60个细胞,且有望将ChIP-Seq做到单细胞水平。

CUT&Tag技术的基本原理为:

在抗体引导下,ChiTag酶仅在目的组蛋白修饰标志、转录因子或染色质调控蛋白结合染色质的局部进行目的DNA的片段化,同时添加测序接头,并释放到细胞外。由于绝大部分无关的染色质还留在细胞核内,因此整个实验的信噪比大幅提高,同时简化了实验步骤。该方法可一管式高通量应用,并可与单细胞测序平台“无缝”结合。ChiTag酶在打断基因组的同时加上接头,不需要繁琐的补平加A加接头,在一天内可以完成从细胞到测序文库制备全流程。

 

CUT&Tag和ChIP-seq比较:

艾美捷 CUT&Tag技术科研工具:

 

EpiGentek的CUT&RUNCUT&Tag技术。特别是 EpiQuik CUT&RUN M6A RNA富集试剂盒(P-9018)和EpiNext CUT&RUN M6A RNA-Seq试剂盒(P-9016),可以在小的非特异性背景水平上,从低输入RNA样本中特异性捕获和富集含有m6A修饰的RNA片段。富集的 RNA 特别适用于快速构建非条形码(单重)和条形码(多重)文库,允许以更小的偏差和高分辨率绘制 m6A 区域。

 

cat#     名称  时长

P-2028 EpiNext CUT&RUN Fast Kit  <3小时

P-9018 EpiQuik CUT&RUN m6A RNA Enrichment (MeRIP) Kit  <3小时

P-9016 EpiNext CUT&RUN RNA m6A-Seq Kit  <6小时

P-2032 EpiNext cTIP (CUT&Tag In-Place)-Sequencing Kit  <5小时